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Anzano vanta antiche origini, come testimoniato da ritrovamenti archeologici di età romana, tra cui urne cinerarie, iscrizioni ed altri oggetti, conservati in un museo.
A lungo si è creduto che nel suo territorio sorgesse la villa, lungo la via Appia descritta da Orazio nel suo celebre viaggio da Roma a Brindisi. Ciò a cagione del fatto che tale struttura si trovava nell'ampio territorio di Trevico (che comprendeva anche Vallesaccarda e Scampitella), a cui Anzano fu a lungo soggetta, essendo feudo dei suoi Vescovi.
Nel 1929, il borgo irpino venne staccato dalla Provincia di Avellino per essere aggregato a quella di Foggia.